Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Prr27Q3SYJ2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Prr27Q3SYJ2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms