Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccbe1Q3MI99 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms