Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Riiad1Q3KNY5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Riiad1Q3KNY5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms