Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cpne9Q1RLL3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cpne9Q1RLL3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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