Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ptcd3Q14C51 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms