Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ptchd1Q14B62 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ptchd1Q14B62 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms