Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rpusd2Q149F1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Rpusd2Q149F1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Rpusd2Q149F1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Rpusd2Q149F1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Rpusd2Q149F1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Rpusd2Q149F1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Rpusd2Q149F1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rpusd2Q149F1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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