Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Traf3ip1Q149C2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Traf3ip1Q149C2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms