Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VgfQ0VGU4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
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