Protein–RNA interactions for Protein: Q0VET5

Lmntd2, Lamin tail domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd2Q0VET5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmntd2Q0VET5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmntd2Q0VET5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmntd2Q0VET5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmntd2Q0VET5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmntd2Q0VET5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmntd2Q0VET5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmntd2Q0VET5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmntd2Q0VET5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmntd2Q0VET5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lmntd2Q0VET5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lmntd2Q0VET5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lmntd2Q0VET5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmntd2Q0VET5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmntd2Q0VET5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmntd2Q0VET5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmntd2Q0VET5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmntd2Q0VET5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmntd2Q0VET5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmntd2Q0VET5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmntd2Q0VET5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmntd2Q0VET5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmntd2Q0VET5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmntd2Q0VET5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmntd2Q0VET5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmntd2Q0VET5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmntd2Q0VET5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lmntd2Q0VET5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.1 ms