Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cntnap5bQ0V8T8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cntnap5bQ0V8T8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cntnap5bQ0V8T8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cntnap5bQ0V8T8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cntnap5bQ0V8T8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cntnap5bQ0V8T8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cntnap5bQ0V8T8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cntnap5bQ0V8T8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cntnap5bQ0V8T8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cntnap5bQ0V8T8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cntnap5bQ0V8T8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cntnap5bQ0V8T8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms