Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Neurl1bQ0MW30 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Neurl1bQ0MW30 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms