Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ubxn2bQ0KL01 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn2bQ0KL01 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms