Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Kcnma1Q08460 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kcnma1Q08460 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms