Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tgm3Q08189 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms