Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnn2Q08093 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms