Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnn1Q08091 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnn1Q08091 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms