Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
F13bQ07968 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F13bQ07968 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
F13bQ07968 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
F13bQ07968 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F13bQ07968 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13bQ07968 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13bQ07968 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13bQ07968 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13bQ07968 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
F13bQ07968 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms