Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Pou6f1Q07916 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Pou6f1Q07916 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms