Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Col9a2Q07643 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Col9a2Q07643 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms