Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nfe2Q07279 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms