Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Siah1bQ06985 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Siah1bQ06985 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms