Protein–RNA interactions for Protein: Q06890

Clu, Clusterin, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CluQ06890 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CluQ06890 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CluQ06890 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CluQ06890 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CluQ06890 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CluQ06890 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CluQ06890 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CluQ06890 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CluQ06890 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CluQ06890 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CluQ06890 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CluQ06890 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CluQ06890 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CluQ06890 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CluQ06890 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CluQ06890 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CluQ06890 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CluQ06890 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CluQ06890 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CluQ06890 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CluQ06890 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CluQ06890 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CluQ06890 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CluQ06890 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CluQ06890 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CluQ06890 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CluQ06890 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CluQ06890 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CluQ06890 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CluQ06890 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CluQ06890 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CluQ06890 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CluQ06890 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CluQ06890 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CluQ06890 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CluQ06890 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CluQ06890 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CluQ06890 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CluQ06890 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CluQ06890 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CluQ06890 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CluQ06890 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CluQ06890 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CluQ06890 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CluQ06890 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CluQ06890 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CluQ06890 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CluQ06890 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CluQ06890 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CluQ06890 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CluQ06890 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CluQ06890 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CluQ06890 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CluQ06890 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CluQ06890 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CluQ06890 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CluQ06890 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CluQ06890 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CluQ06890 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CluQ06890 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CluQ06890 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CluQ06890 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CluQ06890 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CluQ06890 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CluQ06890 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CluQ06890 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CluQ06890 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CluQ06890 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CluQ06890 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CluQ06890 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CluQ06890 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CluQ06890 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CluQ06890 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CluQ06890 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CluQ06890 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CluQ06890 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CluQ06890 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CluQ06890 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CluQ06890 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CluQ06890 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CluQ06890 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CluQ06890 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CluQ06890 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CluQ06890 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CluQ06890 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CluQ06890 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CluQ06890 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CluQ06890 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CluQ06890 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CluQ06890 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CluQ06890 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CluQ06890 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CluQ06890 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CluQ06890 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CluQ06890 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CluQ06890 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CluQ06890 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CluQ06890 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CluQ06890 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CluQ06890 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms