Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox4Q06831 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sox4Q06831 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms