Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrx2Q06348 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms