Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cab39Q06138 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cab39Q06138 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms