Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vmn1r236Q05A06 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r236Q05A06 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms