Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Thbs3Q05895 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Thbs3Q05895 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms