Protein–RNA interactions for Protein: Q05738

Sry, Sex-determining region Y protein, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SryQ05738 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SryQ05738 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SryQ05738 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SryQ05738 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SryQ05738 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SryQ05738 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SryQ05738 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SryQ05738 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SryQ05738 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SryQ05738 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SryQ05738 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SryQ05738 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SryQ05738 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SryQ05738 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SryQ05738 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SryQ05738 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SryQ05738 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SryQ05738 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SryQ05738 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SryQ05738 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SryQ05738 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SryQ05738 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SryQ05738 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SryQ05738 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SryQ05738 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SryQ05738 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SryQ05738 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SryQ05738 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SryQ05738 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SryQ05738 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SryQ05738 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SryQ05738 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SryQ05738 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SryQ05738 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SryQ05738 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SryQ05738 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SryQ05738 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SryQ05738 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SryQ05738 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SryQ05738 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SryQ05738 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SryQ05738 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SryQ05738 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SryQ05738 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SryQ05738 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SryQ05738 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SryQ05738 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SryQ05738 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SryQ05738 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SryQ05738 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SryQ05738 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SryQ05738 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SryQ05738 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SryQ05738 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SryQ05738 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SryQ05738 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SryQ05738 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SryQ05738 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SryQ05738 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SryQ05738 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SryQ05738 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SryQ05738 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SryQ05738 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SryQ05738 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SryQ05738 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SryQ05738 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SryQ05738 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SryQ05738 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SryQ05738 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SryQ05738 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SryQ05738 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SryQ05738 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SryQ05738 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SryQ05738 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SryQ05738 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SryQ05738 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SryQ05738 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SryQ05738 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SryQ05738 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SryQ05738 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SryQ05738 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SryQ05738 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SryQ05738 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SryQ05738 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SryQ05738 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SryQ05738 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SryQ05738 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SryQ05738 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SryQ05738 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SryQ05738 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SryQ05738 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SryQ05738 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SryQ05738 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SryQ05738 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SryQ05738 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SryQ05738 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SryQ05738 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SryQ05738 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SryQ05738 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SryQ05738 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms