Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col9a1Q05722 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Col9a1Q05722 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col9a1Q05722 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col9a1Q05722 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Col9a1Q05722 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a1Q05722 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a1Q05722 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a1Q05722 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a1Q05722 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a1Q05722 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a1Q05722 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a1Q05722 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a1Q05722 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a1Q05722 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Col9a1Q05722 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms