Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Apoc2Q05020 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc2Q05020 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms