Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sox12Q04890 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sox12Q04890 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms