Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sox10Q04888 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox10Q04888 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox10Q04888 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox10Q04888 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox10Q04888 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox10Q04888 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox10Q04888 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox10Q04888 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox10Q04888 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox10Q04888 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox10Q04888 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sox10Q04888 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox10Q04888 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox10Q04888 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox10Q04888 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox10Q04888 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox10Q04888 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox10Q04888 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox10Q04888 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox10Q04888 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox10Q04888 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox10Q04888 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sox10Q04888 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox10Q04888 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox10Q04888 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox10Q04888 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox10Q04888 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox10Q04888 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox10Q04888 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox10Q04888 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sox10Q04888 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sox10Q04888 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms