Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scg2Q03517 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Scg2Q03517 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Scg2Q03517 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms