Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tff2Q03404 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tff2Q03404 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms