Protein–RNA interactions for Protein: Q03366

Ccl7, C-C motif chemokine 7, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl7Q03366 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl7Q03366 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl7Q03366 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl7Q03366 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl7Q03366 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl7Q03366 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl7Q03366 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl7Q03366 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl7Q03366 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl7Q03366 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl7Q03366 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl7Q03366 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl7Q03366 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl7Q03366 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl7Q03366 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl7Q03366 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl7Q03366 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl7Q03366 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl7Q03366 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl7Q03366 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl7Q03366 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl7Q03366 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl7Q03366 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl7Q03366 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms