Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Thbs2Q03350 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms