Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ddr1Q03146 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ddr1Q03146 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms