Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fgfr4Q03142 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fgfr4Q03142 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fgfr4Q03142 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fgfr4Q03142 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fgfr4Q03142 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fgfr4Q03142 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fgfr4Q03142 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fgfr4Q03142 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Fgfr4Q03142 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fgfr4Q03142 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fgfr4Q03142 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fgfr4Q03142 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Fgfr4Q03142 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Fgfr4Q03142 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Fgfr4Q03142 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms