Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Col6a2Q02788 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Col6a2Q02788 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms