Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gjb4Q02738 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gjb4Q02738 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gjb4Q02738 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms