Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GscQ02591 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GscQ02591 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GscQ02591 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GscQ02591 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GscQ02591 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GscQ02591 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GscQ02591 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GscQ02591 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GscQ02591 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GscQ02591 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GscQ02591 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GscQ02591 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GscQ02591 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GscQ02591 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GscQ02591 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GscQ02591 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GscQ02591 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GscQ02591 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GscQ02591 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GscQ02591 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GscQ02591 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GscQ02591 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GscQ02591 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GscQ02591 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GscQ02591 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GscQ02591 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GscQ02591 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GscQ02591 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GscQ02591 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GscQ02591 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GscQ02591 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GscQ02591 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GscQ02591 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GscQ02591 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GscQ02591 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GscQ02591 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GscQ02591 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GscQ02591 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GscQ02591 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GscQ02591 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GscQ02591 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GscQ02591 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GscQ02591 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GscQ02591 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GscQ02591 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GscQ02591 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GscQ02591 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GscQ02591 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GscQ02591 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GscQ02591 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GscQ02591 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
GscQ02591 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GscQ02591 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GscQ02591 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GscQ02591 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GscQ02591 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GscQ02591 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GscQ02591 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GscQ02591 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GscQ02591 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GscQ02591 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GscQ02591 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GscQ02591 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GscQ02591 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GscQ02591 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GscQ02591 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GscQ02591 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GscQ02591 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GscQ02591 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GscQ02591 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GscQ02591 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GscQ02591 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GscQ02591 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GscQ02591 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GscQ02591 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GscQ02591 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GscQ02591 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GscQ02591 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GscQ02591 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GscQ02591 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GscQ02591 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GscQ02591 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GscQ02591 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GscQ02591 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GscQ02591 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GscQ02591 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GscQ02591 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GscQ02591 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GscQ02591 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GscQ02591 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GscQ02591 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GscQ02591 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GscQ02591 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GscQ02591 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GscQ02591 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GscQ02591 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GscQ02591 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GscQ02591 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GscQ02591 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms