Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Htr1fQ02284 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms