Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snai1Q02085 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snai1Q02085 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms