Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
VcpQ01853 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VcpQ01853 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VcpQ01853 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VcpQ01853 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VcpQ01853 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VcpQ01853 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VcpQ01853 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VcpQ01853 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VcpQ01853 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VcpQ01853 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VcpQ01853 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
VcpQ01853 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms