Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cacna1cQ01815 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cacna1cQ01815 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms