Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nme2Q01768 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nme2Q01768 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nme2Q01768 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nme2Q01768 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nme2Q01768 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nme2Q01768 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nme2Q01768 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nme2Q01768 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nme2Q01768 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nme2Q01768 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Nme2Q01768 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms