Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gja5Q01231 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gja5Q01231 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms