Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Col1a2Q01149 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col1a2Q01149 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms