Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Grin2bQ01097 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Grin2bQ01097 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Grin2bQ01097 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Grin2bQ01097 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Grin2bQ01097 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Grin2bQ01097 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Grin2bQ01097 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Grin2bQ01097 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Grin2bQ01097 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Grin2bQ01097 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Grin2bQ01097 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Grin2bQ01097 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Grin2bQ01097 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Grin2bQ01097 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Grin2bQ01097 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Grin2bQ01097 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Grin2bQ01097 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Grin2bQ01097 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Grin2bQ01097 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Grin2bQ01097 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Grin2bQ01097 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Grin2bQ01097 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Grin2bQ01097 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Grin2bQ01097 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Grin2bQ01097 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Grin2bQ01097 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Grin2bQ01097 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Grin2bQ01097 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Grin2bQ01097 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Grin2bQ01097 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Grin2bQ01097 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Grin2bQ01097 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Grin2bQ01097 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Grin2bQ01097 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Grin2bQ01097 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Grin2bQ01097 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Grin2bQ01097 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Grin2bQ01097 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Grin2bQ01097 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Grin2bQ01097 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms